La fragmentación espermática ocurre cuando la molécula de ADN sufre alguna rotura en la cadena. Cuando estas roturas son muchas, y en muchos espermatozoides, la probabilidad de que el espermatozoide que consigue fecundar al ovocito esté dañado, y las probabilidades de que el ciclo vaya mal son mayores.

Está técnica evalúa el estado en el que se encuentra el ADN de los espermatozoides, localizado en la cabeza de los mismos, y que constituye su carga genética. A mayor número de roturas o lesiones de este material genético, más difícil será conseguir el embarazo.